Klaster GPU, który uczy się czytać sen
Jedna prawdziwa noc z pracowni snu Fundacji MT5. Pipeline pimento sam rozkłada ją na zdarzenia, fazy i wskaźniki.
dane zanonimizowane · badanie diagnostycznePracownie snu Fundacji MT5 i klaster GPU w fundacji
Fundacja MT5 prowadzi pracownie snu w szpitalach. Każda noc badania to kilkanaście zsynchronizowanych sygnałów: mózg, serce, oddech, saturacja, ruch. Dostarczyliśmy całą stronę techniczną: sprzęt, wdrożenie, zbieranie danych, pipeline i klaster NVIDIA Blackwell w fundacji, na którym trenujemy własny model.
przebiegi na stronie: prawdziwy zapis jednej nocy, zanonimizowany, godziny przesunięte · zdarzenia i hipnogram: automatyczna analiza pipeline'u pimento, poglądowo, nie opis lekarski · wartości oznaczone „ilustracja” są poglądowe
mt5.foundation ↗Jedna noc, a w opisie zostaje kilka liczb
Badanie polisomnograficzne rejestruje całą noc: fale mózgowe, pracę serca, każdy oddech, saturację krwi, ruch i pozycję ciała. Opis badania skupia się na tym, po co pacjent przyszedł, czyli na zaburzeniach snu. Reszta zapisu, godziny zsynchronizowanych sygnałów z całego organizmu, zwykle zostaje w archiwum. Chcemy sprawdzić, co jeszcze jest w niej zapisane.
- 01cała noc w kanałach
- 02opis badania
- 03reszta zostaje w archiwum
- 04pytanie: co jeszcze tam jest?
zaczyna się w szpitalnej pracowni →
Pracownia snu w szpitalu bez inwestycji szpitala
Fundacja MT5 uruchamia pracownie snu w szpitalach w modelu „pracownia snu bez inwestycji”. Po naszej stronie jest wszystko, co techniczne: dobór i dostarczenie sprzętu, wdrożenie stanowisk, rejestratory NOX A1s i droga, którą każdy zapis trafia rano do fundacji. Personel szpitala zakłada czujniki i nadzoruje noc, a nie zajmuje się IT.
- 01stanowisko w pracowni
- 02czujniki i NOX A1s
- 03noc: zapis trwa
- 04rano: plik do fundacji
podział ról do potwierdzenia przez fundację · rzut sali: ilustracja
a w środku pliku: cała noc →
Osiem godzin w kilkunastu kanałach
Prawdziwa noc z jednej z pracowni, zanonimizowana i przyspieszona kilka tysięcy razy. Pod przebiegami rośnie mapa aktywności mózgu i hipnogram, który nasz pipeline wyliczył sam z EEG, ruchów gałek ocznych i aktywności. Niżej kreski zdarzeń wykrytych automatycznie. Jedno z nich obejrzymy z bliska.
- 01zapis na żywo
- 02przyspieszony zegar
- 03pipeline opisuje noc
- 04zdarzenia nocy
hipnogram i zdarzenia: automatyczna analiza pipeline'u pimento · poglądowo, nie opis lekarski
03:50. Oddech staje
Przepływ znika na 38 s, a pasy na klatce i brzuchu też stoją: oddech zatrzymuje się bez ruchu oddechowego. Saturacja spada z opóźnieniem, dno wypada 26 s po wznowieniu. Przy wznowieniu zmienia się EEG, wybucha chrapanie, a oddech wraca serią głębokich wdechów. Jedno zdarzenie zostawia ślad w kilku układach naraz. Takie zależności ma widzieć model.
- 01przepływ: zero
- 02pasy: bez ruchu
- 03SpO2: spadek z opóźnieniem
- 04EEG: wybudzenie, oddech wraca
- 05zoom: 180 s → 1 oddech
opis neutralny: bez określania typu zdarzenia · pomiary z zapisu, zdarzenie wykryte automatycznie
takich nocy jest wiele. co z nimi robimy? →
Z pliku EDF+ do okien dla modelu, bez wyjścia poza fundację
Każdy zapis trafia na klaster GPU NVIDIA Blackwell, który stoi w fundacji. Anonimizacja, filtracja, wspólna siatka próbkowania i wyrównanie kanałów co do próbki. Potem pipeline sam opisuje noc: zatrzymania oddechu, desaturacje, wybudzenia i poglądowy hipnogram. Na końcu tnie ją na okna dla modelu. Dane pacjentów nie trafiają do chmury.
- 01anonimizacja
- 02filtracja
- 03resampling
- 04wyrównanie w czasie
- 05opis nocy: auto
- 06okna
filtr EEG 0,3–35 Hz i okno 30 s: parametry tego pipeline'u
okna gotowe. czego model ma się z nich nauczyć? →
Zakrywamy jeden sygnał. Model musi go odtworzyć
Uczymy własny model na wielu nocach naraz. W każdym oknie zakrywamy jeden kanał, np. saturację, i każemy modelowi odtworzyć go z pozostałych: z oddechu, pracy serca, fal mózgowych, ruchu. Żeby to zrobić, model musi zrozumieć, jak te sygnały od siebie zależą. Nikt nie musi mu tego wcześniej opisywać.
- 01okna z wielu nocy
- 02osobno: mózg, serce, oddech…
- 03jeden kanał zakryty
- 04rekonstrukcja
- 05mapa zależności
R&D w toku · schemat poglądowy · rekonstrukcja w animacji i mapa: ilustracja
model rozumie sen. a co, jeśli sen mówi o czymś więcej? →
Czego jeszcze może dotyczyć sen
Nocą organizm pracuje bez zakłóceń dnia, a model widzi naraz serce, oddech, mózg i saturację. Sprawdzamy, czy w tych wzorcach widać ślady chorób, z którymi pacjent nie przyszedł do pracowni. To otwarte pytania badawcze. Nie mamy jeszcze wyników i nie będziemy ich ogłaszać przed rzetelną weryfikacją.
- 01serce: rytm, arytmie
- 02nadciśnienie
- 03metabolizm, cukrzyca
- 04układ nerwowy
- 05nastrój, depresja
- 06udar
R&D w toku · bez wyników · odcisk nocy z danych tej nocy, pozostałe noce: wkrótce
a jutro w nocy przyjdzie kolejny zapis →
Każda kolejna noc wchodzi w ten sam proces
Dziś pracownie fundacji nagrywają około stu nocy miesięcznie, a cel jest znacznie wyższy. Każda noc przechodzi tę samą drogę: rejestrator, plik, pipeline, model. Wszystko na sprzęcie w fundacji, który obsługujemy technicznie od początku do końca. Pytania badawcze sprawdzamy dopiero wtedy, kiedy danych jest dość, żeby odpowiedź coś znaczyła.
- 01pracownia
- 02EDF+
- 03pipeline
- 04model
- 05pytania badawcze
karty kolejnych nocy: ilustracja
Masz dane, które leżą w archiwum?
Zapisy z aparatury, które po opisie nikomu się już nie przydają, mogą być materiałem do własnego modelu. Postawimy klaster u Ciebie, zbudujemy pipeline i będziemy go utrzymywać, a dane zostaną w Twojej infrastrukturze.